Konservierte Struktur bei genetischer Mosaizität : die Tailspike Proteine dreier Phagen der Familie Podviridae

Tailspike proteins of three Podoviridae : genetic mosaics with conserved hreedimensional structure

  • Die Tailspike Proteine (TSP) der Bakteriophagen P22, Sf6 und HK620 dienen der Erkennung von Kohlenhydratstrukturen auf ihren gram-negativen Wirtsbakterien und zeigen, von den ersten 110 Aminosäuren des N-Terminus abgesehen, keine Sequenzübereinstimmung. Mit Röntgenkristallstrukturanalyse konnte gezeigt werden, dass HK620TSP und Sf6TSP ebenfalls zu einer parallelen, rechtsgängigen beta-Helix falten, wie dies schon für P22TSP bekannt war. Die Kohlenhydratbindestelle ist bei Sf6TSP im Vergleich zu P22TSP zwischen die Untereinheiten verschoben.
  • The bacteriophages P22, Sf6 and HK620 need their tailspike proteins (TSP) for recognition of surface carbohydrates on their gram-negative host bacteria. Sequence identity is completely lacking in their C-terminal 500 to 600 amino acids. The three TSP have the same fold, an oligomeric parallel beta-helix, as shown by crystal structure analyses of HK620TSP and Sf6TSP. Compared with P22TSP, the carbohydrate binding site of Sf6TSP is located at the interface between two monomers and not on a single monomer.

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Metadaten
Author details:Stefanie BarbirzORCiDGND
URN:urn:nbn:de:kobv:517-opus-6885
Supervisor(s):Robert Seckler
Publication type:Doctoral Thesis
Language:German
Publication year:2005
Publishing institution:Universität Potsdam
Granting institution:Universität Potsdam
Date of final exam:2006/01/16
Release date:2006/04/07
Tag:Kohlenhydrat-Protein-Wechselwirkung; Tailspike; genetisches Mosaik; parallele beta-Helix
carbohydrate binding site; genetic mosaicism; parallel beta-helix; tailspike
GND Keyword:Bakteriophagen; Skleroproteine; Helix <beta->; Lipopolysaccharide
RVK - Regensburg classification:WF 3300
RVK - Regensburg classification:WD 5500
Organizational units:Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät / Institut für Biochemie und Biologie
DDC classification:5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie
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